プレスリリース：2008年1月15日
2007年12月31日DNASTAR社【SeqMan Genome Assembler(SMGA) Early Release版】リリース開始
米国DNASTAR社 SeqMan Genome Assembler Early Release版をリリース開始
PDFファイル遺伝子解析ソフト開発会社、米国DNASTAR社より2007年12月末日、次世代シーケンサーアッセンブラーSeqMan Genome Assembler(以下SMGA)、Early Releaseバージョンが発売開始されました。
このアプリケーションの導入により、従来のSeqManProにて可能であった454LifeScienceTMおよびサンガーシーケンスからのデータのみならず、Illumina社®のSolexaマシーンからの配列データもデスクトップ型コンピューターにて高速にアッセンブルすることが可能になりました。
- 機能について
SeqMan Genome Assembler (SMGA) はコマンドライン操作によって、Illumina®, 454®, そしてサンガーテクノロジーからのシーケンスデータを独自のアルゴリズムでアッセンブルするアプリケーションです。
Windows® XP X 64 and Mac OS X 10.4 両プラットフォームにてご使用いただけます。
SMGAではassembling parametersを使用してデータセット特有の条件に調節することで完全なフレキシビリティを提供し、ベクターやエンドトリミング、既知のリピートやプライマーなどのコンタミ配列をアッセンブリから削除するなどのプロセス前オプションを設定することもできます。
既知のSNPs, CDs, その他のフィーチャーをアッセンブル前にSeqBuilderにてテンプレート配列に対してアノテーション付けするとSeqMan Proにおける推定SNPsの同定解析をより強化することができ、SMGAによるアッセンブル後には、保存したプロジェクトをSeqMan ProにてSNPs同定やカバー率解析などの解析用に閲覧することができます。
- ベータテストについて
さらに、ただ今ベータテスターとしてSMGAの機能を確認テストしていただくことができます。お客様のデータサンプルをお送りいただいてメーカーにて解析をし、結果をお客様のお手元で判断していただくことができます。詳しくは弊社までお尋ねください。
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