複合データの関連因子系統解析
Helix Tree
複合データの関連因子系統解析
HelixTree®は、米国GoldenHelix社とGlaxoSmithKline社との共同にて開発された、複合遺伝子 解析ソフトウェアです。
HelixTree® は、大規模な臨床試験のデータを解析し、遺伝子情報、環境 因子、薬効能および副作用間の複雑な関係を効率的に解明します。 同一スプレットシート上に表現型と遺伝子型に関する情報を入力し、着目する因子に対して、その他の因子とどの様な関連があるのかをリカーシブパーテショニング法で分析します。結果は、分かりやすい決定木（デシジョンツリー）で表示され、フェノタイプとジェノタイプの様々な関係を直感的に解析・理解することができます。データもバイナリ型、数値型、文字型に加えて、遺伝子型も入力でき、ファーマコゲノミクスにおいて効率的な解析が可能です。 phenotype/genotypeの関連を見つけ出すことで、最大の効能を発揮し、かつ最小限の副作用と なるよう｢カスタマイズされた｣医薬品を創ることが可能となります。 急速に業界で標準となりつつある臨床試験における遺伝データ解析を強力にサポートします。
特長
- 最新のファーマコジェノミクスに必要となる強力な統計計算機能（Recursive partitioning法）
- 複雑な遺伝子と遺伝子、遺伝子と環境因子、および環境因子と環境因子の相互作用の解析
- 連鎖不平衡解析
- Hardy-Weinberg平衡解析
- SNPマップ上のHaplotype解析
- アレル可視化チャートの表示
- 複数ツリー生成機能
- 相関関係/交互作用グラフ表示
- Affymetrix社、Illumina社のチップデータや様々なデータ形式のインポートが可能（ODBC, Microsoft Access, Excel, S-Plus, SAS, SPSS, Gauss, 他）
- Affymetrix社 GeneChip® Mapping 10K, 100K, 500K Array, SNP5.0, 6.0 に対応
- Illumina社 BeadStudioデータ に対応
- コピー数解析機能 Copy Number Analysis Module (CNAM オプション)
- 履歴管理画面により過去の解析結果を繰り返し参照可能
- スクリプトによるバッチ処理可能
システム環境
Windows
- OS：Microsoft Windows® NT, 2000, XP, Vista
- CPU：Intel Pentium® 相当以上
- メモリ：512MB
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Linux
- OS：Linux 32-bit
- CPU：Power PC G4 & G5, Intel processors
- メモリ：512MB
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Macintosh
- OS：Mac OS X 10.4.x
- CPU：Power PC G4 & G5, Intel processors
- メモリ：512MB
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Whole Genome Analysisを行う場合(推奨)
- CPU: Intel Pentium® 4 相当以上
- メモリ: 2GB以上
- ハードディスク:80GB以上
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お問い合わせ
株式会社ネットウエル ライフサイエンス営業部
TEL：03-5368-3459
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