グリカン構造予測解析
SimGlycan
グリカン構造予測解析
質量分析器からの実験MSプロファイルを読み取り、7000グリカン以上あるフラグメントのデータベースから一致するものを探索し、テストサンプルのグリカン構造の予測リストを作成します。それぞれの結果は、スコアによって表示され、その他のグリカンクラス、反応、パスウェイ、酵素などの情報もリファレンスとして容易に表示されます。
- グリカン質量分析同定ツール
SimGlycanは革新的なグリカン質量同定ツールです。スコアと共にグリカン構造の予測を行い、所有するテストサンプルに最もマッチするグリカンのリストを提供します。
これにより、時間および手間を大幅に削減することができます。
- グリコシル化反応および翻訳後修飾研究用グリカン質量同定
グリコシル化反応はグリカンがタンパク質に付加された結果のことであり、タンパク質翻訳後修飾の内、最も一般的な反応であります。糖質は、胚発生、細胞内・細胞間活動、免疫機能調整、ホスト組織への病原体誘導、細胞分裂およびタンパク質調整と相互作用などを含む様々な生物過程に関わっています。
それらの研究に対し、SimGlycanは質量分析によるMS/MSデータからグリカン構造を予測します。質量分析装置から生成されるMSプロファイルを取り込み、独自のデータベースと照らし合わせて、最も可能性のあるグリカン構造のリストを作成いたします。それぞれの構造はどれだけサンプルがデータに類似しているかによってスコア付けされます。グリカンクラス、反応、パスウェイおよび酵素などの構造に対する追加情報も表示されるので、それらの情報を収集する時間も省くことができます。
システム環境
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